El cardenal arzobispo de Valencia ha asegurado en una entrevista en el diario La Razón que "cuando se genera odio", en una clara referencia al independentismo, "es no es ser cristiano". En ese sentido, Cañizares entiende que la Iglesia debería haber sido "más clara" contra el "desafío separatista", mostrándose "muy dolido" porque el 1 de octubre se escondieron urnas del referéndum en iglesias catalanas.

Abundando en el conflicto catalán, Cañizares ha querido dejar claro que "en el caso de secesión", esto no sería compatible con ser un buen católico. "Lo digo cuando se trata de países democráticos. No se puede ser católico en Italia y defender el secesionismo", zanja.

Cañizares también ha querido hacer alusión a la fe del líder de ERC, Oriol Junqueras, reconocido creyente del que el arzobispo ha querido desmarcarse: “Ni el señor Junqueras ni nadie puede decir que el secesionismo se apoya en la Iglesia. Cuando se genera odio, una violencia que no es simplemente violencia física sino agresión al contrario, eso no es ser cristiano”. A lo que ha añadido: “El independentismo ha suscitado odios que no existían”.

Responde de esta forma a las declaraciones de Junqueras en la Audiencia Nacional en las que venía a decir que nunca sería partidario de la violencia. “Violencia, nunca, jamás, por muchas razones. Soy creyente. Mis convicciones mes alejan y me impiden cualquier acto violento de cualquier forma”.

Por último también ha tenido unas palabras para con el obispo Xavier Novell, asegurando que está "confundido" y que “tergiversar la verdad histórica no es querer a Catalunya”. Además, el arzobispo dice que le resulta “muy extraño” que en todo el proceso de Catalunya no ha escuchado a “nadie referirse a los pobres, a los que se quedarán si trabajo, a los verdaderamente perjudicados”.