El juez instructor de la causa del procés, Pablo Llarena, ha acordado emitir orden nacional de detención para Clara Ponsatí una vez que el magistrado ha constatado que la exconsellera de Educación de la Generalitat de Catalunya "no ha justificado con una causa legítima" su incomparecencia ante el juez para prestar declaración indagatoria por el delito de desobediencia por el que está procesada. 

El magistrado considera que "todo apunta a que la investigada ha desatendido voluntaria e injustificadamente la citación judicial", por lo que acuerda su detención nacional, con la finalidad de tomarle declaración indagatoria, "sin perjuicio de que pueda dejarse sin efecto si la procesada comparece voluntaria y personalmente ante el instructor", como ocurrió con otras dos procesadas en esta causa, Meritxel Serret y Anna Gabriel. 

Ponsatí, eurodiputada de Junts, fue citada personalmente para comparecer ante Llarena el pasado 24 de abril. La procesada no se presentó en el Tribunal Supremo y su defensa incorporó un escrito en el que expresó, como justificación de su inasistencia, que la encausada forma parte de dos Comisiones del Parlamento Europeo, una de ellas como miembro suplente. 

Llarena explica que, aunque el mencionado escrito no concretaba que la incomparecencia de Ponsatí viniera motivada por su asistencia a estas comisiones parlamentarias, su defensa sugirió la incompatibilidad de ambas tareas, consta en el auto.

En aquel escrito Ponsatí también solicitaba la paralización del procedimiento judicial por haberse impulsado ante el Parlamento Europeo un procedimiento de amparo de los privilegios e inmunidades parlamentarias.